Etiket: ödüllü

Gary Ruvkun, genlerin hücrelerimizi nasıl oluşturduğunu kontrol eden moleküller olan MicroRNA’nın, insanların hastalıklarla mücadele etme biçimini geliştirmenin ve hatta dünya dışı yaşam belirtileri bulmanın anahtarı olabileceğini söylüyor.

Nobel Tıp veya Fizyoloji Ödülü, Pazartesi günü Rovkun ve meslektaşı Victor Ambros’a, 1993 yılında hangi genlerin aktif olduğunu ve ne zaman aktif olduklarını kontrol etmeye yardımcı olan, mikroRNA adı verilen, daha önce bilinmeyen bir molekül grubunu keşfetmeleri nedeniyle verildi. Bu, karmaşık yaşam formlarının büyümesi ve işleyişinde hayati bir rol oynar.

Gary Ruvkun, Harvard Tıp Fakültesi’nde genetik profesörüdür. Konuş Tuhaflıklar ve kuarklar Sunucu Bob MacDonald, hayatını değiştiren keşfinden ve diğer gezegenlerde yaşam bulmak için RNA’yı nasıl kullanmayı umduğundan bahsediyor. İşte o konuşmanın bir kısmı.

Stockholm’den telefon geldiğinde nasıl hissettin?

Yaklaşık 20 yıldır oynanıyor. Böylece sabah saat dörtte telefon çaldığında kaydolmak bir dakika sürdü ve eşim cevap verdi ve “İsveç aksanı var!” dedi. Sonra “Ah!”

Genlerin nasıl açılıp kapandığını nasıl anlamaya başladığımızı söyle bana. [which] Bu sizin mikroRNA üzerinde çalışmanıza yol açtı.

İşte bu küçük parçada genetik analiz yapılarak bu gün ışığına çıktı [worm called a] Nematodlar. Yani nematodlar toprak ekosisteminin büyük bir parçası ve çok basit; 959 hücreye sahipler ve her hücrenin bir adı var. Böylece 1982’de Victor Ambros’un yaptığı gibi çalışmaya başladım ve hayvanları oluşturan hücrelerin soyu üzerinde birlikte çalıştık.

Bu, mikroRNA’nın rolünün keşfedilmesine nasıl yol açtı?

Bu genlerin ne olduğunu öğrendiğimizde bunlardan birinin şimdiye kadar görülen tüm genlerden yaklaşık beş kat daha küçük bir ürünü kodladığı ortaya çıktı. Yalnızca 25 nükleotid (RNA ve DNA’nın yapı taşları) uzunluğundaydı. Bu biraz garip kabul edilen yeni bir olguydu ve gerçekte ne anlama geldiği belli değildi.

Bunun yeni bir genetik molekül olduğunu ne zaman anladınız?

Bunlar ilk günler. Bu noktada elimizde herhangi bir genom yoktu ama beş yıl içinde genomlar ortaya çıkmaya başladı. Bunu keşfetme şeklimiz [microRNA was present in the human genome] Bu mikroRNA’lardan, bu çok küçük genlerden başka bir gen mi aldık ve bu bir insandaydı [equivalent]Solucanın genomunu 25 harfle karşılaştırarak cevaba ulaştı ve aynı 25 harf insan genomunda da vardı.

Bu mikroRNA’lar gerçekte ne yapar?

Diğer hedef genleri düzenlerler, her türlü farklı işlemi gerçekleştirirler ve temel olarak her hayvanda ve her bitkide kullanılırlar. Yani bu, bir milyar yıl önceki bitkilerle hayvanlar arasındaki fark kadar eskidir. Örneğin 5000 yıl önce mısırın evcilleştirilmesinde yer almışlardı.

Bu mutasyonlar yerli halkların seçtiği şeylerdir. Bunu yaptıklarını bilmiyorlardı ama heterozigot mutasyonlar olarak adlandırılan mutasyonlara sahiplerdi; bunlar, geliştikçe işleri farklı şekilde yapan mutasyonlardır. Bu mısır koçanlarının daha büyük olmasını sağlar.

Son zamanlarda bilginizi güneş sistemimizin dışındaki mikrobiyal yaşamı aramak için uyguladığınızı anlıyorum. Bana bundan bahset.

Evet öyle bir tutkum vardı. Böylece kendimizi RNA biyolojisinin zenginliğine kaptırmış olduk ve örneğin ribozomun nasıl çalıştığını anlamaya çalışan uzun bir gelenek var.

Ribozom, tüm hücrelerimizdeki haberci RNA’yı alıp proteinlere çeviren küçük makinedir. Ribozomun ana bileşeninin, proteinler evrimleşmeden önce var olan RNA olduğu ortaya çıktı.

Bu RNA, Dünya üzerinde en çok korunan şeydir ve dünyanın dört bir yanındaki biyologlar, kar ve buz, göletler, okyanusun derinlikleri, insan dışkısı gibi egzotik ekosistemlere bu şekilde giderler. Ribozomda bulunan DNA parçalarını arayarak orada ne olduğunu arayabilirsiniz.

NASA’yı, Mars’ta yaşamı bu şekilde aramaları gerektiğine ikna etmeye çalışıyordum ve onlar her zaman “Evet, ama bu çok Dünya merkezli bir bakış açısı” diyorlardı. Hayatı aramaktan. Sen aptal mısın?” Benim cevabım, önce bunu aramamamız aptallık olur.

Mars’ın yaşamdan bağımsız olarak evrimleşeceğini düşünüyorsanız bu çok saçma, çünkü elbette Dünya ile Mars arasına yayılacak. Birbirlerine yakındırlar ve aralarında çok hızlı bir alışveriş vardır. Dünya üzerinde Mars göktaşları var ve bunların sayısı çok fazla değil, ancak bakterilerin gezegen sistemleri arasında hareket etmesi için çok fazla şeye ihtiyacınız yok.

MikroRNA araştırmalarının gelecekte görmeyi umduğunuz uygulamaları var mı?

Evet. Demek istediğim, artık izlerin ne olduğunu bulmaya devam edeceğiz. Yaptığımız en büyük şeylerden biri, bu küçük RNA’ların hedeflerine sunulmasında rol oynayan proteinler hakkında artık çok daha fazla şey biliyor olmamız.

Bu proteinlerden bazılarının insanlarda veya hayvanlar aleminin çoğunda bulunmadığını biliyoruz, ancak solucanlarda, kenelerde ve örümceklerde, mercanlarda var ve bunlar antiviral savunmayı bizden daha iyi yapan organizmalar.

Yani çoğu böcek ve tüm omurgalılar gibi pek çok hayvanın neden eski antiviral yollarını terk ederek interferon yolu adı verilen yolu geliştirdiğini, yani virüslerle nasıl savaştığımızı anlamaya çalışıyoruz. Demek istediğim, kıyaslandığında pek iyi durumda değiliz.